Avonturier-geoloog Dr. Martin Pepper wil zijn theorie bewijzen: dat het echte Atlantis op het Griekse eiland Santorini bestond en werd verwoest tijdens de grootste vulkaanuitbarsting in de menselijke geschiedenis. Om zijn doel te bereiken zal Pepper nieuw wetenschappelijk bewijs gebruiken dat is verzameld met behulp van ultramoderne sonarscans van de zeebodem en microscopische analyse van het eeuwenoude landschap. Hij moet Santorini ook koppelen aan een reeks belangrijke aanwijzingen die zijn ingebed in de allereerste beschrijving van Atlantis door de Griekse filosoof Plato – van het vreemde ringvormige ontwerp van de verloren stad tot de rol die Egyptische priesters speelden bij het vastleggen van de legende. Aan het einde van het programma onthult hij de verbluffende bevindingen die de stad kunnen lokaliseren en precies laten zien hoe deze eruit zag.
